1999年至2003年，管委會作為市政府的派出機構(gòu)，專門負責區(qū)內(nèi)經(jīng)濟開發(fā)建設，集中行使市一級經(jīng)濟管理權(quán)限，實行u201c一條龍服務、一站式管理、一個窗口對外u201d。行使外經(jīng)、工商、稅務、海關(guān)、勞務、國土、規(guī)劃等13個部門授予的審批和辦理權(quán)，推動了工業(yè)園的高速發(fā)展．

2006年8月份起南屏科技工業(yè)園管委會由香洲區(qū)政府管理，內(nèi)設辦公室、建設管理局、經(jīng)濟發(fā)展局，編制人員10個。負責土地開發(fā)、企業(yè)經(jīng)濟、安全生產(chǎn)等工作。市政設施管理由市、區(qū)相關(guān)市政單位負責，行政審批由市相關(guān)部門負責。